国民党在“九合一”中选举中惨败于民进党，原因甚多，但各界并未认为主要败因是两岸政策。连民进党也公开表示，此次选举不是对两岸政策的公投，显示其无意藉其大胜全面否定两岸关系，以保留他们自己朝务实方向调整的空间。