河北农大完成世界首个枣全基因组测序

29.10.2014  10:12

    河北新闻网 保定 10月28日电(河北日报、河北新闻网记者王敬照)记者今天从河北农业大学获悉,该校刘孟军教授及其研究团队历经3年多艰辛努力,在世界上率先完成了枣的高质量全基因组测序。这也是世界鼠李科植物和我国干果树种中第一个完成基因组测序的物种。

    据介绍,枣的基因组属于高度复杂的类型,其测序和组装的难度很大。刘孟军教授带领其枣研究团队在第二代测序技术基础上,综合采用BAC-to-BAC和WGS-PCR-free方法,成功开展了对我国著名枣品种“冬枣”的全基因组测序工作,组装出高质量的枣基因组序列,总长达4.38亿个碱基,占预估枣基因组大小的98%,同时将其中80%的序列锚定到了枣的12条假染色体上。该研究还注释出32000多个基因,这里面包含大量的枣特色基因。特别是在第一号染色体上,发现了一段高度保守的区域,这一段和抗逆、多糖代谢相关,为枣的特殊生物学性状的分析提供了重要线索。

    枣果是世界上已知维生素C含量最为丰富的果品之一,比苹果、梨高出数十倍,甚至超过人们所熟知的富含维生素C的柑橘和猕猴桃,但枣果大量积累维生素C的内在机制一直是个谜。刘孟军通过大量的比较基因组和转录组的分析发现,枣同时具有了柑橘和猕猴桃两种积累维生素C的分子机制,这在其他果树中是没有见到的。此外,本研究还揭示了枣树抗旱、耐盐以及“落枝归根”而非“落叶归根”等独特和优异性状形成的分子机制。

    据了解,北京时间10月29日,国际权威科学杂志《自然通讯》(Nature Communications)将在线发表该枣基因组测序重大研究成果。该成果的问世,将对加速枣树功能基因组学研究、促进枣树乃至鼠李科和其他果树的遗传改良和分子育种等工作产生重大而深远的影响。